- USS Audacious
- USS Augur
- USS Augustus
- USS Aurelia
- USS Aurelius
- USS Aurora (Ambassador class)
- USS Aurora (Arbiter class)
- USS Aurora (Constitution class)
- USS Aurora (Defender class)
- USS Aurora (Galaxy X class)
- USS Aurora (Guardian class)
- USS Aurora (Interceptor class)
- USS Aurora (NCC-72321)
- USS Aurora (NCC-91270)
- USS Austerlitz
- USS Austerlitz (NCC-1742)
- USS Austerlitz (NCC-4308)
- USS Austin
- USS Austin (proposed)
- USS Australia
- USS Avalanche
- USS Avalon (NCC-63887)
- USS Avalon (Sovereign class)
- USS Avatar
- USS Avebury
- USS Avenger (Defiant class)
- USS Avenger (NCC-1860)
- USS Avenger (NCC-1980)
- USS Avenger (NCC-97500)
- USS Aventine
- USS Aventine personnel
- USS Avondale
- USS Axanar
- USS Ayers
- USS Aylwin
- USS Azetbur
- USS Azov
- USS Azrael
- USS B'hala
- USS B'intok
- USS Baade
- USS Baal
- USS Baalbek
- USS Baba Yaga
- USS Babur
- USS Babylon (NCC-2125)
- USS Babylon (Sovereign class)
- USS Baccarat
- USS Bacchus (NCC-26288)
- USS Bacchus (NCC-92780)
- USS Bach
- USS Bader
- USS Bagration
- USS Bahu
- USS Bailiff
- USS Bainbridge
- USS Baines
- USS Baker (mining freighter)
- USS Baker (prototype)
- USS Bakersfield
- USS Bakker
- USS Balaklava
- USS Balboa
- USS Baliste
- USS Ballista
- USS Ballista (NCC-1603)
- USS Ballista (NCC-52053)
- USS Balmung
- USS Balthamar
- USS Baltic (24th century)
- USS Bangkok (London class)
- USS Bangkok (Steamrunner class)
- USS Bannockburn
- USS Banshee
- USS Banting (NCC-58929)
- USS Banting (NCC-639)
- USS Baracus
- USS Barb
- USS Barb (NCC-1932)
- USS Barbados
- USS Barbaros
- USS Barcelona (Aerie class)
- USS Barcelona (Steamrunner class)
- USS Barclay
- USS Barcley d'Tolly
- USS Bardabunga
- USS Barker
- USS Barnard (NCC-10007)
- USS Barnard (Rigel class)
- USS Barr
- USS Barracuda (Defiant class)
- USS Barracuda (NCC-4026)
- USS Barracuda (Oberth class)
- USS Bartholemew Dynass
- USS Barzani
- USS Basie
- USS Basilone
- USS Basra
- USS Bastion (NCC-2527)
- USS Bastion (NCC-811)
- USS Bataan
- USS Bataan (24th century)
- USS Bataan (NCC-1900)
- USS Bateson
- USS Batidor
- USS Baton Rouge (2360s)
- USS Baton Rouge (Defiant class)
- USS Baton Rouge (prototype)
- USS Batu
- USS Baum
- USS Bayer
- USS Bayinnaung
- USS Bayuda
- USS Bear
- USS Bearn
- USS Beaty
- USS Bedwara
- USS Begin
- USS Begin (Akira class)
- USS Begin (NCC-801)
- USS Beholder
- USS Behr'ak
- USS Beijing (Aerie class)
- USS Beijing (London class)
- USS Beijing (NCC-1657)
- USS Belair
- USS Belfast (Galaxy X class)
- USS Belfast (NCC-75633-C)
- USS Belize
- USS Belknap
- USS Belknap (NCC-1811)
- USS Belknap (NCC-2501)
- USS Bell (NCC-1974)
- USS Bell (NCC-35031)
- USS Bell (Nebula class)
- USS Bell (proposed)
- USS Bellatrix (NCC-1832)
- USS Bellatrix (repair ship)
- USS Belleau Wood
- USS Belleau Wood (23rd century)
- USS Belleau Wood (Iwo Jima class)
- USS Belleau Wood (NCC-1901)
- USS Bellerophon (NCC-62048)
- USS Bellerophon (NCC-62048-A)
- USS Bellerophon (NCC-74705)
- USS Bellingham
- USS Bellipotent
- USS Bellisarius
- USS Benedict
- USS Benevolence
- USS Benjamin Franklin (NCC-013)
- USS Bennington (Defiant class)
- USS Bennington (NCC-2251)
- USS Beowulf (24th century)
- USS Beowulf (NCC-1605)
- USS Bergen
- USS Berkeley (Miranda class)
- USS Berkeley (NCC-64720)
- USS Berkeley (proposed)
- USS Berlin (London class)
- USS Berlin (NCC-14232)
- USS Berlin (NCC-1658)
- USS Berlin (NCC-2001)
- USS Berlin (NCC-2731)
- USS Bermuda
- USS Bern
- USS Berry
- USS Berserker (NCC-2507)
- USS Berserker (NCC-4016)
- USS Berwick
- USS Berytus
- USS Bessel
- USS Betelgeuse (Excelsior class)
- USS Betelgeuse (NCC-1822)
- USS Betelgeuse (NCC-2520)
- USS Betelgeuse (repair ship)
- USS Beth Bigelow
- USS Bhutto
- USS Biela
- USS Biko
- USS Bill of Rights
- USS Billings
- USS Billy Bishop
- USS Binar (Excelsior class)
- USS Binar (NCC-1819)
- USS Binar (disambiguation)
- USS Binary
- USS Birmingham
- USS Bishop
- USS Bismarck (Defender class)
- USS Bismarck (NCC-1761)
- USS Bismarck (NCC-3225)
- USS Bismarck (Sovereign class)
- USS Bismark
- USS Black Elk
- USS Blackheart
- USS Blackpool
- USS Blackthorne
- USS Blackwell
- USS Blade of Tellar
- USS Blake (Galaxy class)
- USS Blake (NCC-4389)
- USS Blakely
- USS Blakey
- USS Blenheim
- USS Blucher
- USS Blumberg
- USS Boadicea
- USS Bode
- USS Bodley
- USS Bodø
- USS Boehm
- USS Bogota
- USS Bohr (Merian class)
- USS Bohr (NX-92880)
- USS Boise
- USS Bold Venture
- USS Bolivar
- USS Bolivar (Galaxy class)
- USS Bolivar (NCC-1862)
- USS Bolivar (NCC-4411)
- USS Bolzano
- USS Bombay
- USS Bombay (Larson class)
- USS Bombay (NCC-1926)
- USS Bombay (NCC-1926) personnel
- USS Bonaparte
- USS Bonaventure (24th century)
- USS Bonaventure (NCC-1000)
- USS Bonchune
- USS Bondar
- USS Bondi
- USS Bondorant
- USS Bonestell
- USS Bonhomme Richard (Constitution class)
- USS Bonhomme Richard (Galaxy class)
- USS Bonhomme Richard (Nebula class)
- USS Bonn
- USS Boone (Constitution class)
- USS Booth
- USS Borealis
- USS Borga
- USS Boridi
- USS Borj
- USS Borland
- USS Borodino
- USS Bosewell
- USS Boston (Akula class)
- USS Boston (Miranda class)
- USS Boston (NCC-42076)
- USS Boston (mining freighter)
- USS Bostwick
- USS Boudicca
- USS Bougainville
- USS Bougainville (Iwo Jima class)
- USS Bougainville (NCC-61809)
- USS Boughn
- USS Bowie
- USS Bowman
- USS Boxer
- USS Boxer (Aegian class)
- USS Boxer (Defiant class)
- USS Boxer (NCC-2204)
- USS Boyaca
- USS Boyle
- USS Boynton
- USS Bozeman (NCC-1941)
- USS Bozeman (NCC-1941-A)
- USS Bozeman (NCC-90500)
- USS Bradbury (Kelvin timeline)
- USS Bradbury (NX-72307)
- USS Bradley
- USS Bradshaw
- USS Brahe (Constitution class)
- USS Brahe (NCC-3821)
- USS Brahmaputra
- USS Brandenburg
- USS Brasi
- USS Brattain
- USS Brave Shield
- USS Braverman
- USS Brazas
- USS Brazzaville
- USS Breedlove
- USS Breitenfeld
- USS Bremen
- USS Bremerton
- USS Bridger
- USS Brigadier
- USS Brigham Young
- USS Brigid
- USS Brin
- USS Briostrys
- USS Brisbane
- USS Brisbane (24th century)
- USS Brisbane (Aerie class)
- USS Brisbane (Miranda class)
- USS Brisbane (NCC-2030)
- USS Britannia
- USS Broadsword (Aegian class)
- USS Broadsword (Oberth class)
- USS Bronstein
- USS Brooklyn
- USS Brouwer
- USS Bruges
- USS Brunswick
- USS Brussels
- USS Buchanan
- USS Buckley
- USS Budapest
- USS Budapest (NCC-64923)
- USS Budapest (Steamrunner class)
- USS Budington
- USS Buena Vista
- USS Buenos Aires (2260s)
- USS Buenos Aires (NCC-1660)
- USS Buenos Aires (proposed)
- USS Buford
- USS Bulwark
- USS Bunker Hill
- USS Bunker Hill (NCC-1745)
- USS Bunker Hill (NCC-1767)
- USS Buran (NCC-08)
- USS Buran (NCC-1422)
- USS Buran (NCC-57580)
- USS Buran (NCC-57580) (II)
- USS Buran (NCC-96400)
- USS Burbank
- USS Burke
- USS Bursilev
- USS Burton
- USS Burundi
- USS Bush
- USS Buthelezi
- USS Byblos
- USS Byrd
- USS Byzantium
- USS C. Lewis (Galaxy class)
- USS C. Lewis (NCC-1718)
- USS Cabot (NCC-1427)
- USS Cabot (NCC-1902)
- USS Cabot (NCC-91480)
- USS Caddebostan
- USS Caelian
- USS Caesaria